Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00846Q9NV44 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms