Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF275Q9NSD4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms