Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP26Q9NRE1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms