Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms