Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms