Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms