Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms