Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4CQ9C0C4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms