Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms