Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCD2Q9BXW9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCD2Q9BXW9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms