Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms