Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms