Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms