Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD1Q9BUP0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD1Q9BUP0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms