Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTA3Q9BTC8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms