Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms