Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms