Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms