Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms