Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORCS2Q96PQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms