Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD27Q96NW4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms