Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms