Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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