Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms