Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDC3Q96F86 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDC3Q96F86 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDC3Q96F86 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDC3Q96F86 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDC3Q96F86 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDC3Q96F86 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms