Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNRIP1Q96F85 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNRIP1Q96F85 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms