Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF428Q96B54 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF428Q96B54 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms