Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms