Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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