Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms