Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms