Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms