Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARMIL3Q8ND23 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms