Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms