Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms