Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms