Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms