Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms