Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASC4Q6P4E1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms