Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms