Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCSAPQ6IQ19 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms