Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A4Q6AI14 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms