Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms