Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP350Q5VT06 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms