Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEX3CQ5U5Q3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms