Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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