Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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