Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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