Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA3Q53S33 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms