Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q499Y3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms